Software for Microbiology

Oprócz mikroskopów i szalek Petriego komputery są ważnym narzędziem dla mikrobiologów. Oprogramowanie do badań mikrobiologicznych obejmuje narzędzia wykorzystywane przez inne dyscypliny naukowe i inżynierskie, a także specjalistyczne aplikacje do badania bakterii i innych mikroorganizmów. Wiele aplikacji opracowanych przez agencje rządowe, fundacje non-profit lub badaczy akademickich jest dostępnych jako bezpłatne oprogramowanie do pobrania i użycia zgodnie z wymaganiami eksperymentu lub laboratorium.

Narzędzia do wizualizacji
Fizyczny lub umysłowy obraz gromadzone surowe dane mogą pomóc w lepszym zrozumieniu jego jakości, znaczenia i implikacji. Oprogramowanie do wizualizacji danych o otwartym kodzie źródłowym i komercyjnym jest powszechnie dostępne do badań mikrobiologicznych. Twórz wykresy i wykresy swoich danych za pomocą LibreOffice Calc, Microsoft Excel lub systemu wizualizacji danych Mondrian. Aplikacje Cell-O i RasMol pomagają w tworzeniu modeli animowanych biologicznie istotnych cząsteczek 2D i 3D, takich jak białka i aminokwasy.

Modelowanie matematyczne
Duże zbiory danych mikrobiologicznych często dostarczają bardziej znaczących informacji był analizowany numerycznie. Pakiety oprogramowania MATLAB, Octave i SciPy, które dokonują matematycznego udoskonalenia, analizy i modelowania danych naukowców. Użyj tych pakietów do oszacowania parametrów poprzez dopasowanie krzywej, prognozy epidemiologiczne, symulacje wzrostu bakterii i szum danych lub eliminację efektów stochastycznych. Aplikacje te wykonują również obliczenia statystyczne, takie jak analiza wariancji lub testy chi-kwadrat.

Genome Bioinformatics
Aplikacje oprogramowania mikrobiologicznego pomagają również wizualizować i zbierać informacje z sekwencji kwasów nukleinowych, które tworzą mikro- DNA organizmu. Open Bioinformatics Foundation zapewnia bezpłatne aplikacje do sekwencjonowania i analizy DNA o otwartym kodzie źródłowym, takie jak BioJava i Biopython, które wyodrębniają dane z banków informacji genomowych, analizują kod DNA organizmu i porównują go z innymi próbkami DNA. Dodatkowe pakiety do analizy genomu obejmują Emboss, HMMER, Clustal Omega, Phylogeny Inference Package lub PHYLIP, a także Sequence Manipulation Suite lub SMS.

Oprogramowanie referencyjne - Szybkie tempo odkryć naukowych w mikrobiologii i zmianie rządu przepisy sprawiają, że mikrobiolodzy mają łatwy dostęp do informacji, które mają wpływ na ich pracę. HUGO to komercyjny pakiet oprogramowania zapewniający mikrobiologom aktualne informacje na temat narzędzi, chemikaliów, sprzętu, pożywek hodowlanych, wymogów bezpieczeństwa, nowych organizmów, zmian taksonomicznych i antybiotyków. Ponadto mikrobiolodzy pracujący w dziedzinie nauki o żywności mogą korzystać z aplikacji ComBase Browser Web, aby uzyskać dostęp do danych mikrobiologicznych związanych z żywnością dostarczanych przez agencje rządowe w Wielkiej Brytanii, Australii i Stanach Zjednoczonych.

URL:https://pl.whycomputer.com/Internet/100308339.html